mRNA第三方质检服务
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帽结构及加帽率检测原理

mRNA的结构主要包括 5'端帽子( cap,简称帽子) 、5'端非翻译区(untranslated region,UTR)、开放阅读框( open reading frame,ORF) 、3'端非翻译区和多聚腺苷酸尾巴 [Poly( A) ]等结构。成熟的真核生物 mRNA的 5'端都有1个甲基鸟苷帽( m7G) 结构。加帽能够帮助mRNA 被顺利转运出细胞核,增加 mRNA 稳定性,防止其被核糖核酸酶降解,对蛋白的表达至关重要。


加帽率检测目前采用的主要手段是先合成与5'UTR区前50nt左右相配对的含有生物素的探针,让探针和mRNA结合,然后用RNase H进行酶切,利用链霉亲和素磁珠特异性的富集带有帽子结构序列的探针,最后将探针上的含有帽子结构的序列洗脱下来,进入到LC-MS进行分析。


Poly(A)结构及Poly(A)分布检测原理

真核生物的mRNA通常在其3'端有一段腺苷,根据物种的不同,其长度从20到200多个碱基不等。最近有一些研究表明mRNA较长的尾巴可以提高翻译效率,提供mRNA的稳定性,并影响免疫反应。

目前主要采用RNase T1酶进行酶切,酶切后的Poly(A)片段用Oligo DT填料进行富集,将富集在填料上的Poly(A)片段洗脱下来后进入到 LC-MS进行分析。

第三方检测服务

质量控制作为药物开发最重要的一环,对于药物成分、杂质等的分析是药物开发过程中的重中之重。瀚海新酶提供mRNA药物第三方质检服务

■  自主建立的质量控制分析平台                        ■  mRNA加帽率检测              ■  mRNA Poly(A)分布检测                 ■  质粒分析方法开发验证

■  LNP组分含量分析方法开发验证                     ■  产品和工艺杂质研究           ■  原辅料检测                                         ■  一站式CMC整体解决方案

Beverly M.; Dell A.; Parmar P.; Houghton L. Label-free analysis of mRNA capping efficiency using RNase H probes and LC-MS. Anal. Bioanal. Chem. 2016, 408 (18), 5021–5030. 10.1007/s00216-016-9605-x.
提交需求
销售确认
样品检测
输出报告
交付标准
- DELIVERY STANDARDS -

服务类别

用时(工作日)交付标准
加帽率检测探针设计合成5探针根据客户需求确定
加帽率检测样品前处理
2前处理样品
加帽率检测样品上机检测
3-10检测报告
Poly(A)分布检测样品前处理2前处理样品
Poly(A)分布检测样品上机检测
3-10检测报告
过往案例
- CASE -
· 加帽率检测 ·
· Poly(A)分布检测 ·
· 加帽率检测分子量匹配表 ·

Name

Response

Observed  

mass (Da)

Expected 

mass (Da)

Mass error

 (mDa)

Mass error

 (ppm)

%Cap1

Monphos

38908

7004.385

7004.297

88.1

12.6

95.1%

Triphos

1052878

7164.479

7164.256

223.1

31.1

Triphos_a

506256

6835.276

6835.05

225.3

33.0

Diphos_a

101498

6755.327

6755.071

256.5

38.0

cap1

23880426

7471.694

7471.551

143.2

19.2

cap1_gaa

1924043

6468.059

6467.933

125.6

19.4

cap1_a

5077712

7142.483

7142.345

138.5

19.4

cap1_aa

2301145

6813.278

6813.139

139.1

20.4

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